Sebuah serangan cyber menyebabkan seluruh identitas mata-mata aktif untuk Inggris terbongkar. Ditengah masa pensiunnya, Johnny English kembali dipanggil untuk menjalankan misi rahasia karena hanya ia satu-satunya mata-mata yang identitasnya belum diketahui. Johnny ditugaskan untuk menemukan dalang di balik peretasan yang dilakukan. Namun sebagai mata-mata tua yang tergolong gagap teknologi, Johnny dihadapkan dengan tantangan berupa teknologi yang lebih modern. Mau tak mau, ia harus berusaha menaklukkan tantangan supaya misinya bisa berhasil.